Domains: N-terminal (N) O, Endonuclease (EN) O, C-terminal (C) O.
Intein* (length) Block positions
Sce_VMA (455) 11-2-----33---------44-----11----------22-33-44---------221
Ctr_VMA (472) 11-2-----33--------44-----11-------------22-33--44---------221
Pfu_VMA (425) 112-------33-44----11--------22-33-44--------------221
Pho_VMA (377) 112-------33-44----11--------22---44---------221
Pab_VMA (430) 112-------33-44----11--------22-33-44---------------221
Tac_VMA (174) 112-------33-44----221
Ppu_dnaB (151) 11--2---3344----221
Gth_dnaB (161) 112------3344----221
Mtu_dnaB (417) 112-----3344--11---------22-33--44-----------------221
Mav_dnaB (338) 11-2----33--------11-----22-33-44--------221
Ssp_dnaB (430) 112-----3344--11----------22-33--44------------------221
Rma_dnaB (429) 112-----3344--11----------22-33--44------------------221
Mle_dnaB (146) 11-2----3344----221
Mfl_gyrA (422) 112-----33-44--11---------22-33--44----------------221
Mgo_gyrA (421) 112-----33-44--11---------22-33--44----------------221
Mka_gyrA (421) 112-----33-44--11---------22-33--44----------------221
Mxe_gyrA (199) 112-----33-44---------221
Mma_gyrA (421) 112-----33-44--11---------22-33--44----------------221
Mle_gyrA (421) 112-----33-44--11---------22-33--44----------------221
Pfu_RIR1-1 (455) 11-2--------33-44-11-----------33-44------------------221
Pab_RIR1-1 (400) 11-2--------33-44-11--22-33-44------------------221
Pab_RIR1-2 (439) 112----33-44----11----------22-33-44-----------------221
CIV_RIR1 (340) 112----3344----11--------33--44----------221
Spb_RIR1 (386) 112------33-44--11----------22-33--44-----------221
Dra_RIR1 (367) 112----33--44--11---------22-33--44-----------221
Pfu_RIR1-2 (383) 112---------3344--11--------22-33-44----------221
Pho_RIR1 (386) 112----------3344--11--------22-33-44----------221
Pab_RIR1-3 (383) 112---------3344--11--------22-33-44----------221
Mth_RIR1 (135) 112----33-44---221
Pho_r-gyr (411) 112-----33-44-------11------22-33-44---------------221
Mja_r-gyr (495) 112-----33-44-------------11-------22-33--44-----------------221
Pfu_topA (374) 112-----33-44---------11---------3344---------221
Tfu_pol-1 (361) 112---33------11-----------33--44----------221
Tag_pol-1 (361) 112---33------11-----------33--44----------221
Pko_pol-1 (361) 112---33------11-----------33--44----------221
Mja_pol-1 (370) 112---33-------11-----------33--44----------221
Tli_pol-1 (539) 11-2--------33-44-------------------11--------22-33-44------------221
Tag_pol-2 (539) 11-2--------33-44-------------------11--------22-33-44------------221
Psp_pol-1 (538) 11-2--------33-44-------------------11--------22-33-44------------221
Pko_pol-2 (538) 11-2--------33-44-------------------11--------22-33-44------------221
Mja_pol-2 (477) 11-2--------33-44-------------------11--------22-33-44-----221
Pho_pol (461) 11-2--------33-44-------------------11-------22-3344-----221
Tli_pol-2 (391) 11-2-------33-------11---------22-33--44----------221
Tfu_pol-2 (390) 11-2-------33------11---------22-33--44----------221
Tag_pol-3 (158) 11-2-------33-----221
Pfu_klbA (523) 112--------33-44--------11---------22-33-44---------------------221
Pho_klbA (521) 112--------33-44--------11---------22-33-44---------------------221
Pab_klbA (197) 112--------33-44------221
Mja_klbA (169) 112--------33-44--221
Pfu_IF2 (388) 112-------3344-------3344---------------------221
Pho_IF2 (445) 112-------3344-----11-----33-44----------------------221
Pab_IF2 (395) 112-------3344-------33-44----------------------221
Mja_IF2 (547) 112-------3344------------11--------22-33-44-----------------------221
Pfu_rtcB (482) 112-----3344------11-----------22-33---44------------------221
Pho_rtcB (391) 112-----3344------11-------22-33--44-----------221
Pab_rtcB (437) 112-----3344------11----------22-33---44-------------221
Mja_rtcB (489) 112-----3344------11-----------22-33---44------------------221
Pho_RFC (526) 112------33-44-11--------2233-44--------------------------------221
Mja_RFC-1 (549) 112------33-44--11---------22-33-44---------------------------------221
Pfu_RFC (526) 112------33-44-11--------2233-44--------------------------------221
Pab_RFC-1 (500) 112------33-44-11-------2233-44-----------------------------221
Mja_RFC-2 (437) 11-2------33-44-----11----------22-33-44--------------221
Pab_RFC-2 (609) 112-----3344------------------------11----------22-33---44-----------------221
Mja_RFC-3 (544) 112-----3344---------------11----------22-33---44-----------------221
Ssp_dnaX (431) 11-2----3344---------------------------------------221
Mtu_recA (441) 112-----3344--11---------22-33--44--------------------221
Mle_recA (366) 112------3344-11---------2233-44------------221
Mfl_recA (365) 112------3344-11---------2233-44------------221
Pho_radA (173) 11-2-------33-44----221
Pho_CDC21-1 (169) 112--------33-44---221
Pab_CDC21-1 (165) 112--------33-44---221
Pfu_CDC21 (368) 112-------33-44-----33-44-------------------221
Pho_CDC21-2 (261) 112-------33-44---------------221
Pab_CDC21-2 (269) 112-------33-44----------------221
Pfu_lon (402) 11-2-------3344-----11---------22-33-44-----------221
Pho_lon (475) 11-2-------3344-----------11---------22-33---44-----------221
Pab_lon (334) 11-2-------3344----11--------2233-44----221
Pho_polC (167) 11-2-------33-44---221
Pab_polC (186) 11-2-------33-44-----221
Mle_pps1 (387) 112----33--44-----11--------22-33-44-----------221
Mtu_pps1 (360) 11-2----33----44--11---------22-33--44--------221
Pho_LHR (476) 112----33-44-------------11--------22-33--44--------------221
Mja_helicase (502) 112-----33-44--11--------22-33-44----------------------------22-1
Mja_RNR-1 (454) 11-2--------33---44---11--------22-33-44-----------------221
Mja_RNR-2 (534) 11-2--------33-44------------11---------22-33--44------------------221
Ceu_clpp (457) 112-----33--------11---------22----44-------------------221
Ssp gyrB (436) 112-----33-44------NNNN-----------------------------221
Aae_RIR2 (347) 112-----33----44-11--------22-33--44-----221
Pab_moaA (456) 11-2-------33-44------------11--------22-33--44----------221
Mja_hyp1 (393) 11-2----33-----44-----11---------22-3344----------221
Mja_GF6P (500) 11--2---33-44--------------11--------22-33-44-----------------221
Mja_PEPsyn (413) 112------33-----11-------22--33-44---------------22-1
Mja_RpolA1 (453) 112-----3344-------11-----------22-33---44-------------221
Mja_RpolA2 (472) 11-2-------33-44------11--------22-33-44------------------221
Mja_TFIIB (336) 11-2-------33-44--11--------22-3344-------221
Mja_UDPGD (455) 11-2-----33-44-------------11---------22-33--44----------221
Ape_0745 (469) 11-2-------33-44------------11---------22-33-44-----------221
Ssp_DnaE1 (123) 112-----33------
Ssp_DnaE2 ( 37) --221
---- 32 amino acids
* Intein names are colored by their allele groups (integration points
VMA-a, VMA-b,
dnaB-b, dnaB-a,
gyrA-a,
RIR1-a, RIR1-b,
pol-a, pol-b, pol-c,
IF2-a,
klbA-a,
rtcB-a,
RFC-a, RFC-c,
r-gyr-a,
recA-b
CDC21-a, CDC21-b,
lon-a,
polC-a).
| Motif designations | |||
|---|---|---|---|
| This figure | Pietrokovski '97 | Perler '97 & Pietrokovski '94 | Other names |
| 11 | N1 | A | Inteins N-terminal splicing point |
| 2 | N2 | - | - |
| 33 | N3 | B | - |
| 44 | N4 | - | - |
| 11 | EN1 | C | DOD, dodecapepetide, LAGLIDADG, P1 |
| 22 | EN2 | D | - |
| 33 | EN3 | E | DOD, dodecapepetide, LAGLIDADG, P2 |
| 44 | EN4 | H | - |
| NNNN | HNH | - | I-TevIII family motif |
| 22 | C2 | F | - |
| 1 | C1 | G | Inteins C-terminal splicing point |